内镜室纯水系统主要用于内镜清洗消毒机的清洗消毒用水，专用流动水清洗槽、消毒槽、全管道灌流装置的清洗用水，压力水枪，超声清洗器的用水。
纯水管道材质的选择主要考虑造成纯水水质下降的两个因素：
1、管道材质中的不纯物质溶解于高纯水中致使水中阳、阴离子增加、电阻率下降以及TOC增大。
2、因管道内壁不光滑及接头、阀门等原因造成细菌滞留繁殖以及其他颗粒的聚积，致使水中微粒增加。为了减少上述不利因素的影响，应选用可萃性低、内壁光滑的管道并尽可能减少接头及管件的凹凸不平。当然也要根据纯水水质的级别进行选材，并注意材料的价格等，要统筹兼顾。根据材质的不同，高纯水配管主要可分为有机系配管和不锈钢配管两大类。
内镜室纯水系统性能特征：
1.具有完备的节电、节水功能。
1.完备的应急方案，可实现在线维护。
2.RO反渗透主机具有自动脉冲冲洗功能。
3.预处理系统自动冲洗及再生运行功能。
4.具备无水保护，高低压力保护等多种功能。
5.根据各使用点的不同，用水要求可做到统一、分路恒压供水。
6.水质不合格报警、并停机提醒；漏水停机保护。
7.具有多功能监测，可实现水质、流量，压力等在线显示和控制。
8.PLC+触摸屏全自动控制，可统计累计工作时间，具有故障报簧。
9.耗材使用寿命自动提示等功能。
10.无菌水罐，无菌不锈锅储水箱，紫外线杀菌器及臭杀菌器，无菌水循环供水系统。
